Поддерживаемое программное обеспечение

Ниже представлен список программного обеспечения, поддерживаемый на кластерах ЦКП «ДВВР».
Мы можем помочь вам установить и настроить пакеты не входящие в данный список¹.

Операционная система

GNU/Linux (Debian 11)

Компиляторы и ПО для параллельных расчетов

• C/C++ (GCC, Intel Composer)
• Fortran (GNU Fortran, Intel Fortran)
• поддержка OpenMP
• CUDA Toolkit
• MPI (IntelMPI, MVAPICHv2, OpenMPI)
• Intel Parallel Studio Cluster Edition (Inspector, Advisor, Amplifier, Trace Collector and Analyzer)

Специализированные вычислительные пакеты

• Gromacs (2020.06) — молекулярная химия
• Octave (6.2.0)— численная математика
• NAMD (29September2021)— молекулярная динамика
• GAMESS US (2021-r2)— квантовая химия
• Anaconda3 (5.3.1) — анализ данных
• OpenFOAM (2012,2106) — численного моделирования задач механики сплошных сред

Специализированные библиотеки

• Intel MKL — математическая библиотека Intel
• BLAS — базовые подпрограммы линейной алгебры
• SuiteSparse —  библиотека для работы с разреженными матрицами
• ACML — AMD Core Math Library 
• ATLAS — библиотека для линейной алгебры
• FFTW —  библиотека для выполнения быстрого дискретного преобразования Фурье
• GLPK —  GNU Linear Programming Kit
• LAMMPS — пакет для классической молекулярной динамики
• PETSc — Портативный Переносимый Инструментарий для Научных расчетов
• SLEPc — Пакет для работы с разреженными матрицами
• Pymol — свободная система молекулярной визуализации

Вспомогательные пакеты

• ImageMagick  — для чтения и редактирования файлов множества графических форматов

1 — Стоимость услуги рассчитывается согласно «Порядку расчёта, виды и стоимость услуг, оказываемых ЦКП ДВВР».